真菌感染和病毒感染的区别在于病毒感染一般具有自限性，一般7到14天之后，症状会自行好转，疾病就会康复。

但是真菌感染由于持续感染，治疗之后如果好转，有可能会反复发作，所以说出现真菌感染，需要进行抗真菌治疗，需要长时间的用药，避免症状的反复。

真菌感染和病毒感染区别还在于真菌感染具有很强的传染性，能够感染一些身体抵抗力低下、免疫功能受到影响的人群，病毒感染传染性并没有那么强。