眼部囊肿多由于眼睛局部慢性炎症反复剌激引起睑板腺出口堵塞，分泌物潴留形成的睑板腺炎性肉芽肿。

在发病的早期，绿豆大小时，可以用红霉素眼膏或者激素眼膏，如妥布霉素地塞米松眼膏涂于眼内，用毛巾温敷，一天2-3次，每次10-15分钟，有比较好的消炎消肿作用，眼内也可以点左氧氟沙星滴眼液或者普拉洛芬滴眼液进行治疗，如果保守治疗两周，脓肿仍然较大，难以吸收，必须考虑手术切除，平时也要注意用眼卫生，尽量不要用手揉眼睛，眼部少用化妆品，大便要保持通畅，才能避免眼部囊肿的复发。