肛瘘的治疗方法上手术治疗是公认的，可以根治的方式。

肛瘘是由于肛门腺感染引起的化脓性疾病。

成脓后脓液破坏常在皮肤有外口，时常肿痛流脓。

成熟的肛瘘可以触及条索状的漏管，由外口通向肛门内。

在肛门内实现附近也有相应的内口存在，保守治疗指示缓解肿痛的症状而手术是将内口、瘘管、外口一并切除而达到根治的目的。

当然有的肛瘘是由内科疾病引起，比如结核性肛瘘或克罗恩病肛瘘，需要结合内科治疗。