左脚第四个脚趾根部疼痛，多考虑以下几点方面原因。

第一点，多考虑是痛风所导致的相关症状，是嘌呤代谢障碍所引起，建议以低嘌呤饮食降低尿酸进行治疗，必要时可以考虑行手术刮除，一般来说问题不大。

第二个方面，多考虑是运动过量产生的疲劳骨折，这种情况下，建议行x线片检查来明确相关诊断，针对于骨折位移不大的多考虑保守治疗，针对于骨折位移大的多考虑进行手术治疗。