肛门化脓主要是由于肛门里的肛窦中有肛门腺感染引起。

肛窦的开口朝向直肠的方向，所以经常有腹泻或者便秘的时候，粪便和细菌进入了肛窦里堵塞了肛门腺，而引起了化脓。此时，脓液会流入肛门旁边的疏松间隙中，而引发肛周脓肿，需要手术治疗。另一种化脓是肛门旁边表浅的脓肿，多见于局部的疖子或者化脓性汗腺炎或者肛旁的粉瘤或囊肿破溃后继发的感染，也会形成局部的脓肿，需要对症处理。