正常的胚胎孕囊会每天逐渐长大，当发生停育后，孕囊就会随机萎缩，慢慢的，胎心发育消失，胎芽不会再进一步的长大。

同时，胚胎停育后，子宫也不再增大，反而会继续缩小早孕反应，也会逐渐消失，如果是到了中期，妊娠孕妇的腹部也会不见增大，胎动会逐渐消失。妇科检查的时候，宫口是没有开大的，有的时候子宫和停经周数相比较的是不符合停经周数的。胚胎停育，尤其是早期停育常见的原因是胚胎染色体异常，免疫因素异常，还有黄体功能不足，甲状腺功能低下等原因，都可能会导致胚胎早期停育。