盆腔炎的病原体可分为内源性及外源性。

内源性是指来自原寄居于阴道内的微生物群，包括需氧菌及厌氧菌，可仅为需氧菌感染或仅为厌氧菌感染，但以需氧菌及厌氧菌混合感染多见，主要包括金黄色葡萄球菌、溶血性链球菌、大肠埃希菌、脆弱类杆菌、消化球菌、消化链球菌。外源性病原体主要是性传播疾病的病原体，如沙眼衣原体、淋病奈瑟菌，其他有支原体，包括人形支原体、生殖支原体以及解脲支原体，其中以生殖支原体为主。