巧克力囊肿的女性伴有小腹的隐痛，需要进行B超的检查，了解巧克力囊肿的大小。

如果巧克力囊肿比较小可以通过药物治疗来缓解疼痛，如果巧克力囊肿比较大，这时药物治疗效果并不是很好，就需要及时的进行手术治疗。

巧克力囊肿进行手术后也有一定复发的几率，所以术后需要给予药物治疗，而且药物治疗时间的长短，需要根据是否有备孕计划，患者的年龄综合考虑。

年轻女性如果有备孕计划时，在术后给予药物治疗3到6个月就可以进行积极的备孕。如果没有备孕计划的女性，术后有可能需要长期的进行药物治疗。