发生胎停育的原因很多，有些原因是查不出来的。常见的胎停原因是胚胎本身染色体存在异常。

需要做胚胎的染色体检查，同时需要父母双方进行染色体检查。母亲在孕期接触不良刺激，比如射线、药物、甲醛、重金属污染、感染细菌、病毒的，也可以导致胚胎停育，某体内有内分泌代谢及生殖器官结构异常，比如患有甲亢、甲状腺功能减低、子宫畸形、子宫腺肌症等也会导致胚胎停育。所以发生胎停，女性需要检查妇科超声加工优生四项、血糖、血脂、白带常规以及宫颈衣原体、支原体检查，男性还需要检查抗心磷脂抗体、抗精子抗体、抗子宫内膜抗体以及优生优育等各项的检查。