甲胎蛋白1000以上，一般情况下，与肝癌有着密切的关系，肝癌的可能性是非常大的，但是不能100%的肯定甲胎蛋白1000以上就一定是肝癌，因为严重的肝损伤或者肝脏的中毒或者肝硬化等等一些因素，也会引起甲胎蛋白升高的。

甲胎蛋白1000以上不是诊断肝癌的直接标准，只能作为临床的参考，确诊是不是肝癌，要通过影像学检查，通过穿刺活检，通过病理诊断的确诊。病理诊断是确诊肝癌的金标准，早发现，早诊断，早治疗是治愈肝癌和延长寿命的关键所在。