有效控制高血压和各种类型的脑动脉硬化，可减少腔隙性卒中的可能性，是预防本病的关键。

没有证据表明抗凝治疗会带来任何益处，阿司匹林效果也不确定，但由于这些治疗发生严重并发症，风险较低，故也经常应用。其他可适当应用扩血管药物，如舒血宁等增加脑组织血液供应，促进神经功能恢复。应用钙离子拮抗剂，如尼莫地平，氟桂利嗪等。减少血管痉挛，改善脑血液循环，降低腔隙性脑梗塞复发率，活血化瘀类中药对神经功能恢复有所裨益，故也推荐应用。