查卵巢囊肿，月经干净三天是最准确的时候。月经前不要做B超，这个时期只要做B超都会有小的囊肿，这就是生理性的黄体囊肿，和体内的月经内膜激素有一定的关系。来完月经之后这个时期做B超是最准确的，像月经干净3到7天是常规的检查时间。如果有生理性的囊肿，这个时期一定是消失的。如果这个时候做B超还是有囊肿，而且比较大的，那么就考虑不是生理性的了，再根据描述的形状、边界、透声决定是良性还是恶性的，必要的时候查女性肿瘤标志物，或者是三个月后复查等等。年轻的女性，大部分都是生理性的囊肿，所以检查的时候一定选择月经干净3到7天这个时间段。