卵巢巧克力囊肿，打针治疗在停药后40到60天才能够来月经。

卵巢巧克力囊肿是卵巢子宫内膜异位症的一种表现，它可以导致痛经、腹痛以及性生活后疼痛。而卵巢巧克力囊肿，如果比较小，打针主要是注射的促性腺激素释放激素激动剂。它可以抑制卵巢分泌雌激素和孕激素，抑制排卵，短时间内不来月经，能够使子宫内膜的异位病灶萎缩和坏死。而打针治疗期间不来月经，停药后40到60天卵巢功能逐渐恢复，才能够来月经。而且也是下丘脑和垂体的分泌功能先开始恢复，然后排卵。排卵12到14天之后才会来月经。