月经期间自慰一般不会影响月经不调。

影响月经不调最主要的原因是多囊卵巢综合症，女性如果患多囊卵巢综合症可能出现月经不规律、月经量少、闭经、不孕等情况，出现这种情况后，需要进行系统的治疗，月经不规律还需要和内分泌紊乱以及情绪失调所引起的神经官能症进行鉴别，如果女性近期出现比较大的情绪变化，也可能会导致月经不调，如果偶尔一次月经不调，大多数不需要特殊处理，如果反复月经不调有可能影响排卵及受孕，在备孕前可以做详细的检查，除外多囊卵巢综合症及其他子宫病变。