肛瘘是不会影响精子的。

但是肛瘘是一种肛周的感染性疾病，这种疾病需要手术治疗的。因为肛瘘的症状主要是肛门周围破溃流脓，疼痛症状并不明显，但是肛瘘里面已经形成了一个管道，经常会有一些分泌物从内口进入管道，然后从外口流出。这样会反复发作，通过保守治疗以及用药等办法，对于肛瘘的治疗基本上没有什么效果，要想彻底根治肛瘘必须要做手术才能达到目的。一般将肛瘘的瘘管切开或者切除，然后剩下的创面重新去愈合。