导致试管婴儿畸形的常见原因主要包括以下几种：

第一种最为常见，主要是因为移植后的胚胎自行发生的染色体数目或者结构异常所引起的，这种情况需要对畸形的胎儿进行染色体的检查才可以进行准确的判断。

第二种主要是因为胚胎移植着床成功以后，母体接触各种能够致畸的物质所引起的，比较常见的是因为接触各种放射性物质、农药或者其他药物所引起的这种症状，这种情况也是需要通过相关的检查才可以进行准确的判断。

第三种对于试管婴儿出现的肢体畸形有可能是因为妊娠中晚期发生的羊水过少，从而引发胎儿肢体生长受限，或者发生长期压迫性萎缩所引起的，这种情况也是需要出生以后才可以准确的判断。