发烧头疼的厉害的原因，主要有以下几个方面，

首先，要考虑的就是患者出现了严重的上呼吸道感染，这个时候，呼吸道感染可能是病毒感染，也有可能是细菌感染。所以，患者这个时候，需要尽快的完善血常规等检查。必要的时候，患者还要完善胸部CT。如果患者的发烧头疼是细菌感染引起来的，就要积极的使用消炎药。如果患者发烧头疼，是由于感冒病毒引起来的，这个时候，就要积极的对症治疗。另外，如果患者出现了颅内感染，比如说病毒性脑炎的时候，也能够表现为发烧头疼的厉害。这个时候，一定要积极的使用抗颅内感染的药物，并且要降颅压。