治疗高尿酸血症的药物有很多，不同的药物有不同的副作用。

其中排尿酸的药，常用的有苯溴马隆，苯溴马隆的不良反应轻，一般不影响肝肾功能，少数有胃肠道反应，过敏性皮炎和发热相对少见。还有丙磺舒，应用丙磺舒的患者约有5%可能会出现皮疹、发热、胃肠道刺激等。抑制尿酸生成的药物常见的是别嘌醇，别漂醇的不良反应有胃肠道刺激、皮疹、发热、肝损害、骨髓抑制等。碱化尿液的药物主要是碳酸氢钠，碳酸氢钠大量服用可能会引起代谢性碱中毒，并且因钠负荷过高引起水肿。另外，治疗痛风性关节炎的药物秋水仙碱也有相应的副作用，它可能会产生骨髓抑制、肾衰竭、肝坏死等。