霉菌性阴道炎，想要断根治疗，首先要消除诱因。如果患者合并有糖尿病，应给予积极治疗，控制血糖。需要及时停用广谱抗生素、雌激素以及皮质类固醇激素，勤换内裤，用过的内裤盆以及毛巾均应使用开水烫洗。

可以局部用药也可全身用药，主要以局部短疗程抗真菌药物为主。常用的药物有克霉唑制剂，放置于阴道深部，连用七日。全身用药，可以选择氟康唑顿服。对于反复复发的霉菌性阴道炎，可以延长治疗时间到7到14日。对于有症状的男性伴侣，应进行相应的检查及治疗，预防女性重复感染。