复杂性肾囊肿手术需要做肾脏的部分切除术，可以说是比较大的手术。

所谓的复杂的肾囊肿，就是比单纯性的肾囊肿内涵比较多的间隔，而且间隔及囊壁比较厚。这样的情况下，就有可能是恶性肿瘤的可能性，所以如果考虑是复杂性肾囊肿，就需要将这部分的盛组织以及囊肿全部切除，如果囊肿的体积并不大，可以考虑保留肾单位的治疗方式，就是肾脏部分切除术。但是如果通过影像学检查的表现，比如增强CT下囊壁明显增强，这种考虑恶性可能性时，并且囊肿的体积较大，就要进行肾脏的根治性切除术。