首先可能和病毒感染有关系，尤其是一些肝炎病毒和微小病毒。

临床上研究发现，乙型肝炎相关的再生障碍性贫血的病例也是不少的，还可能是应用一些药物有关系比如说氯霉素类的抗生素，磺胺类的抗生素以及抗肿瘤的化学药物和制剂，这些药物对骨髓的抑制和剂量是相关的，但是也与个人的敏感性有关系。

另外是接触x线等以及放射性核素都可以影响DNA的复制，抑制细胞的有丝分裂，感染干扰骨髓细胞的生成，骨髓的干细胞数量可以出现减少的情况。