药物流产时疼痛主要发生在最后一天，服用了米索前列醇促进孕囊排出的过程，整个疼痛时间约1到3小时，具体持续时间因人而异。

由于对疼痛敏感性存在较大的个体化差异，所以疼痛程度也是每个人感觉不一样。大部分人会觉得与平时痛经感觉差不多，有个别人就会痛到无法忍受，需要用止痛药进行对症处理。疼痛的原因是应用米索前列醇促进子宫收缩排出孕囊，子宫肌层的牵拉和收缩引起疼痛。药物流产前要对于疼痛有思想准备，但是也不能过度恐惧，越是担心和害怕疼痛，情绪紧张，届时疼痛的主观感觉越明显，也就越疼。服药后可以正常活动，与周围人多交流，转移注意力，降低疼痛敏感性，同时提前准备好止痛药物，在疼痛严重时酌情口服止痛药缓解疼痛。一般来说，孕囊排出后，疼痛感觉会迅速减轻和消失。