对于桥本甲状腺炎的诊断，首先应该根据甲状腺功能的检查。其中甲状腺相关的抗体包括过氧化物酶抗体和甲状腺球蛋白抗体，这两个抗体主要用来反映自身免疫性甲状腺炎。如果过氧化物酶抗体和或者合并有甲状腺球蛋白抗体阳性的人群，考虑桥本甲状腺炎的可能性较大。其次要结合甲状腺彩超的诊断，甲状腺彩超会有甲状腺弥漫性增大以及甲状腺呈网格样的改变。在桥本甲状腺炎的患者中，属于自身免疫性甲状腺疾病，有些人群会合并有甲状腺功能的异常出现，早期可能会出现甲状腺功能一过性的亢进，后期随时会出现甲状腺功能减退为主的改变。另外，合并患者的症状和体征，如心慌手抖、眼球突出或者是甲状腺的肿大来进行综合的诊断。