病毒感染最明显的症状，可见于全身的任何部位，临床症状绝大多数源于感染引发的炎症和损伤，主要包括：有发烧、畏寒、寒颤、出汗、疲乏、虚弱、精神萎靡、浑身酸痛、四肢无力、食欲不振、有腹痛、腹泻、恶心呕吐、局部淋巴结肿大。

一般感染所在的局部区域出现了隐痛、压痛或者剧烈的疼痛，此外，还可能出现感染相关部位的功能改变，也出现一些异常的反应，比如肝脏感染：会出现肝区的疼痛、恶心、厌食油腻、黄疸；脑部的感染：会出现意识模糊、嗜睡、肌肉抽搐、反应迟钝、感觉异常；呼吸道的感染：可以会持续咳嗽、咳痰、呼吸困难；对部分慢性感染的癌性风险显著上升。