肩膀部位囊肿的原因有很多种，有一些为自发性的囊肿，比较常见的软组织内的囊肿，也有是因局部的肌腱组织损伤之后引发的囊肿，如肩盂切迹囊肿等等，这个是因局部的肱二头肌长头腱附着部位的盂唇撕裂而引发的局部囊肿。

绝大多数的肩部囊肿没有明显的症状，不需要进行特殊的处理，但是当囊肿持续增大压迫到周围的神经后容易引发局部的神经麻痹而导致肌肉萎缩，这种情况则大多数需要进行手术治疗，如比较常见的肩盂切迹囊肿。

此囊肿容易压迫到肩胛上神经而引发肩背部肌肉的萎缩，大多需要进行手术切除等等。