怀孕两个月胎停，主要的原因包括以下几方面。

第一，染色体异常。这包括遗传至父方或者母方的精子或卵子自身携带的染色体有问题，以及受精卵形成之后，受到病毒、细菌、射线、药物、高热、精神、心理因素等等影响而出现的染色体突变。

第二，女性自身有免疫性疾病，比如系统性红斑狼疮、抗磷脂综合症、易栓症。

第三，有宫腔疾病。比如宫腔粘连、子宫内膜息肉、子宫内膜炎等等。如果偶尔一次胚胎停育，是一次偶然事件，不需要特别检查，但出现了两次以上就称为复发性流产，应该到复发性流产门诊做详细的检查，了解是什么原因，治疗好原因才能避免再次妊娠出现胚胎停育的情况。