呼吸道感染支原体、衣原体时患者可以出现相关的临床症状。

患者多表现为剧烈的干咳、一般咳痰情况较少，偶有少许的白粘痰。部分咳嗽较为剧烈的患者，偶有痰中带血丝。一般由于持续的咳嗽，患者有可能出现胸部旁胸腔疼痛的现象。患者多可以出现发热的现象，其体温多为低到中度的发热，患者体温多在37.4摄氏度到38.5摄氏度之间。一般高热相对于少见，有时还可伴有畏寒感。部分患者还可以出现全身的肌肉酸软乏力、疼痛不适，偶有头痛。患者的胃肠道症状相对于少见，部分患者有可能出现轻度的腹泻，有时还可伴有咽喉部的沙哑疼痛。如果产生相应的并发症，亦可出现相关临床症状。