母乳性黄疸发生机制尚不清楚，目前认为，可能和母亲母乳中β-葡萄糖醛酸苷酶的水平较高有关系。

此酶升高时，未结合胆红素在肠道重吸收会增多，从而增加了肝脏处理胆红素的负担，而使血清非结合胆红素升高，引起宝宝黄疸。母乳性黄疸是一个排除性的诊断，通常不需要处置，在停喂母乳24—48小时，黄疸可以明显减轻。但是当胆红素水平达到光疗标准时，应当给予干预，预防胆红素脑病的发生。母乳性黄疸在生后三个月，即会自然减轻，逐渐消失。