EB病毒感染的症状有全身不适、头痛、头晕、胃寒、鼻塞、恶心、呕吐、食欲不振、稀便的。病程自数日至六个月不等，此外还可以表现为发热及轻度病例外，均有发热。有可能淋巴结肿大，70%以上的患者都有淋巴结肿大，另外，咽峡炎约50%的病人有咽痛。另外还有皮疹，约10%的病例与病程1到2周时会出现皮疹多见于躯干部皮疹多为多形性，可呈斑丘疹，猩红热样皮疹等。