小便后腰部两侧酸痛。首先就要考虑的是尿路感染，其次要考虑是积水的可能。

如果是尿路感染，通常表现为尿频、尿急、尿痛，严重者会出现血尿、腰痛、发热的症状，主要是指急性肾盂肾炎，常见的细菌为大肠埃希细菌逆行感染导致。需要做尿常规和培养，确诊断后服用消炎药进行治疗，还要多喝水，勤排尿，第二种情况就是尿路梗阻导致双肾积水。需要做CT明确原因后进行治疗。