近视飞秒手术的危害主要表现为对于角膜上皮和基质层的损伤，其后遗症容易发生术后视力反弹以及角膜溃疡、角膜炎、角膜穿孔等严重的临床疾病。

所以近视飞秒手术之前要进行详细的屈光数据检查、角膜厚度检查、角膜地形图检查、角膜内皮细胞数检查，以及眼轴测量和眼底视网膜疾病的排查，评估一下做完飞秒手术后视力是否可以提高，以及远期并发症，是否存在严重的临床危害。

如果有明确的手术禁忌症，是不可以接受激光飞秒手术治疗的，如果存在相对禁忌症，可以使用眼内晶体植入手术来进行替代治疗，然后还要进行角膜以及角膜局部的保护治疗，一般多采用玻璃酸钠滴眼液、普拉洛芬滴眼液、典必殊眼膏等，进行预防处理。