下丘脑闭经和垂体性闭经是两种不同的疾病。它的治疗原则都是针对病因治疗，因此首先需要找到病因，下丘脑性闭经指的是中枢神经系统及下丘脑各种功能和器质性疾病引起的闭经，它是一种多发于年轻女性的继发性闭经。而垂体性闭经是因为垂体受到损伤，造成促性腺激素分泌减少而引起的闭经，垂体性闭经的原因有很多，如垂体梗死、垂体肿瘤、颅脑损伤、颅内手术、放射、炎症等，空泡蝶鞍综合症、地中海贫血、淋巴细胞性垂体炎。由于下丘脑和垂体功能关系密切，因此临床上二者也有类似之处，治疗主要是针对病因治疗，可补充相应的垂体激素，通过雌激素和孕激素的联合的治疗补充雌激素和建立人工周期。对于有生育要求的，可进行诱导排卵，进行人工授精，体外受精，胚胎移植等辅助生殖技术进行治疗。