引起儿童喉咙有水泡的原因，比较常见的有以下几点。第一点就是比较常见的疱疹性的咽峡炎。通常为病毒感染所导致。出现了这样的情况，经过化验，确诊是病毒感染造成的，那么给予抗病毒的药物治疗，是有效的。必要时可以给予雾化吸入抗病毒的药物，效果能更好一些。第二种就是有可能得了手足口病。那么孩子出现口腔内或者喉咙上有水泡，并且手和足上同时发现有水泡，那么就有可能是得了手足口病。因为手足口病是传染性疾病。一旦发现了孩子患有手足口病，是需要及时的到医院的传染科进行就诊的。