怀孕12周自然流产的原因很多，有没有备孕，备孕期间有没有吃复合维生素叶酸，再一个有没有做过内分泌的检查，激素水平好不好，有没有做过精子质量的检查，精子有没有畸形。

再一个子宫内膜有没有炎症，有没有息肉，有没有营养不良，再一个有没有外伤史或者性生活过度时，以上原因都有可能导致12周自然流产。

还有营养问题也是一个很复杂的问题，如果孕妇营养不良贫血或者有妊娠期合并症比如子痫前期就有可能发生自然流产的可能性，因此我们要从多方面的考虑自然流产的原因。