临床上能够引起发高烧肚子疼的原因有很多，主要根据是否有病原体感染，将其分为感染性发热和非感染性发热。

其中，能够引起非感染性发热常见的原因包括:体温调节中枢的异常，无菌性坏死物质的吸收，内分泌和代谢障碍，自主神经功能紊乱，抗原抗体反应等；能够引起感染性发热常见的病原体包括:病毒，真菌，支原体，衣原体，寄生虫，细菌等，想要明确病因，需要进行相关检查，包括细胞学、血液学、影像学检查等。