内膜薄怀孕了是有胚停的可能性，因为内膜就相当于土壤，如果内膜过薄的话，那么宫腔的环境不好，受精卵在着床的时候容易发生流产或者是胚停。但是胚停的原因绝大部分都是由于绒毛染色体的异常引起的，所以如果胚停，那么可以取胚停的组织，做一个染色体的检查，看看有没有染色体的异常。一般来说，胚胎的染色体异常合并夫妻双方染色体异常的可能性是比较小的。女性在胚停之后要及早地住院手术。因为胚停之后机体的凝血功能有可能会发生变化，有出现大出血的可能性，所以手术一般都要求住院来做。在胚停住院手术之前，可以考虑服用两天的药物，这样可以使孕囊与宫腔壁剥离从而减小损伤。