在怀孕九周肚子疼的原因，考虑可能是由于先兆流产所引起的。

建议立即到医院就诊，做b超检查，看胚胎在宫腔内的情况，是否有胎盘剥离。在同时，此时需要给予孕酮类的药物如地屈孕酮或者黄体酮口服保胎治疗。如果治疗之后没有明显的缓解，及时到医院再次就诊。另外，消化道相关疾病也可能在怀孕期引起肚子疼，而这种情况需要及时的给予相应的处理。