目前认为桥本甲状腺炎是遗传和环境因素共同作用而引起的器官特异性的自身脸型的甲状腺疾病。它的发病机制尚没有彻底的阐明。目前，多数专家和学者认为它属于多基因遗传倾向，其关键因素是自身免疫性的表现的抗体出现。就像与其他的只是免疫性疾病，比如像干燥，还有系统性红斑狼疮一样，有的时候会共同存在。所以他有一定的遗传的因素，同时在这种遗传的家族里面看到了t po AB抗体和TGAb抗体的明显的阳性。这种特异性的抗体，抑制T细胞功能异常，也是本病的基本病因。一般情况下，对于桥本甲腺炎没有出现甲亢，甲减功能异常之前是不需要进行干预的，只要正常的饮食和作息，他是不会影响身体健康的，当出现甲亢的时候，治疗甲亢，出现甲减的时候，治疗甲减就可以。