晚上睡觉起来腿疼的原因通常是因为腿部的肌肉出现了劳损状态而引起的肌肉乳酸堆积过多以及出现了僵硬状态，在肌肉持续收缩用力时会引起肌肉微小损伤，这些都会产生疼痛。

另外，在肌肉劳损状态下、在睡觉或者是翻身时腿部肌肉收缩时还会引起肌肉痉挛，也会导致肌肉小腿的疼痛。对于这种情况的处理，可以在疼痛时进行热敷以及肌肉的反向拉伸，并且在日常生活中要注意避免久站以及下肢长时间负重。另外，还应进行去医院就诊，以排除其他相关系统的疾病。