褐色分泌物有可能会胚胎停止发育，但不是因为褐色分泌物导致的胚胎停止发育，是胚胎停止发育之后有可能会出现胚胎的出血，从而引起褐色的分泌物。

女性在怀孕期间如果出现了褐色的分泌物，要及早的到医院就诊。需要做彩超看看宫腔内胎儿的生长发育情况。另外，也需要抽血检查，看看血中的孕激素水平存不存在异常，如果孕激素水平比较低，有可能会导致受精卵着床不稳，从而引起先兆流产或者是流产。