大便后肛门会痛原因比较多，常见的有以下几点。

第一，痔疮，痔疮排便后肛门有胀痛感，有时还会伴有便后肛门内肉球脱出或者便鲜血。第二肛裂，肛裂的疼痛以撕裂样疼痛为主，出血量比较少，也为鲜红色。第三，肛周脓肿，肛周脓肿最主要是肛旁红、肿、热、痛，排便后疼痛有时会加重。另外，还有一些疾病，比如功能性肛门直肠痛，以及大便干硬与肛门部摩擦等原因，也会引起大便后肛门疼痛。需要明确原因后再进行相应的治疗。