肾结石感染，后果是比较严重的。因为有可能会引起尿源性脓毒血症，感染性休克的发生。如果肾结石合并感染，可能会出现寒战、高热以及肾区叩击痛的情况。建议通过降钙素源检查、白介素六检查、血常规检查、尿常规检查，来进一步明确诊断。必要时，通过静脉输注抗生素的方式来治疗和处理。最常选用的抗生素是盐酸左氧氟沙星，也可以通过静脉输注哌拉西林，头孢类的抗生素对症治疗和处理。必要时，通过超声引导下肾穿刺置管引流，引流出脓液，来缓解感染的症状。感染得到控制以后，然后再根据结石的部位不同、大小不同，选择不同的手术方式来处理结石。