睡完觉后头疼有些可能是由于自身的睡眠因素导致的，比如睡眠不足、睡眠时多梦易醒影响睡眠质量，导致体力和精力没有得到有效的恢复。

有些可能是睡眠过多，在睡眠过多时睡眠的周期节律被打乱，醒来时有些是在深睡眠阶段突然惊醒，会不适应醒来后的外界环境，可能有头痛的表现。

还有的在睡眠时有打鼾造成缺氧从而引发头疼，有些患者头疼和睡眠本身无关，可能见于一些炎症感染因素、受寒着凉。

还有的可能因睡眠时姿势不当影响到颈椎，对一些原本有颈椎病的患者可能在睡醒觉后出现头疼的症状。

还要留意部分患者可能和高血压有关，睡醒觉后注意测量血压，晨起后某些患者出现头疼，还可能和一些额窦炎的患者有关系。