如果肛瘘想用药物来保守治疗，通常可以采用一些痔疮栓或者是消炎药物来进行对症的治疗。

但是药物对于肛瘘的治疗仅仅能够缓解症状，对他的彻底根治没有什么太大作用，因为肛瘘主要是由内口和外口，如果仅仅用药物，可以缓解一些疼痛或者不适的症状，但是他的内口一直存在，经常会有一些分泌物或者细菌，粪便从内口留到肛瘘的管道里面。，这样炎症感染是持续存在的不能够根治，所以对于肛瘘的治疗，要想达到根治的目的，必须采用手术来进行治疗，将瘘管和内口完全切除，在逐渐的恢复。