两个月宝宝腹泻的原因，最常见乳糖不耐受和肠道蛋白过敏。少数情况可能有轮状病毒，或诺如病毒的感染。

可以化验大便并检测病毒抗原以明确。如除外感染性腹泻，主要考虑非感染性。可以检查大便的还原糖实验，除外乳糖不耐受，以及检测过敏源除外肠道蛋白过敏。乳糖不耐受是指由于肠道内乳糖酶不足，在宝宝进食奶粉或母乳后对奶中的乳糖无法及时有效的分解，因此会出现肠壁损伤，消化不良导致腹泻的症状。治疗方面，如果是乳糖不耐受，需要在哺乳前添加乳糖酶，有助于改善症状。严重的时候需要短时使用乳乳糖奶粉，大便好转后再逐渐转奶。而肠道蛋白过敏是肠道对于蛋白的一种异常反应。在进食母乳或奶粉后奶中的蛋白可以造成肠壁的过敏损伤，出现腹泻。明确诊断后，需要换用奶粉如水解蛋白奶粉或氨基酸奶粉，有助于改善症状。