肛周脓肿术后一般愈合的时间大概在一个月左右，当然，对于皮下浅部的小脓肿范围比较小，损伤比较轻的情况下，20多天即可愈合，对于脓肿范围比较大，脓腔比较深，或者术中切除的部分比较多，切口面积较大，损伤比较重的情况下，部分患者愈合时间可以延长至两个月左右，脓肿愈合后，大部分患者可伴有肛瘘后遗症，表现为切口附近，肛周有一块口，时有脓水流出，时肿时消，像这种情况下建议行第二次肛瘘根治术。