绝大多数婴儿肺炎并不会留有后遗症，肺部痊愈之后也不会留有痕迹。但还是会有一部分婴儿在肺炎好转之后留有后遗症，具体有以下几种：慢性肺炎、闭塞性细支气管炎、肺纤维化，甚至因为长时间的缺氧，上呼吸道时间太长，导致脑瘫，出现智力水平和运动能力双方面的倒退现象。

其原因包括感染的病原种类、数量以及病毒，如腺病毒三型和七型，可以导致非常严重的肺炎，导致留有后遗症。小朋友抗病能力的强弱也是出现并发症的因素之一。在治疗方面，治疗开始时间太晚、不规范，也容易导致留有后遗症，家长应该注意。