脑炎患者大多数核磁共振检查不能够检查出来，只有少部分的患者可能会在核磁共振检查时出现一些责任的病灶，大多数患者在发病后两周方可以出现影像学上的病灶表现。

脑炎的诊断主要是根据患者的症状表现，并结合脑电图以及抽取脑脊液进行病原学检查，以明确诊断。多数脑炎可能会出现发热、头痛、恶心、呕吐，可以出现肢体无力、感觉障碍、头晕、平衡障碍、语言功能障碍，主要取决于病灶的部位，患者也可以出现精神症状和癫痫发作等等。