控制海马体萎缩的方法主要有以下几个方面，首先，一定要积极的查找能够引起海马体萎缩的病因，然后针对性治疗，比较常见的能够引起海马体萎缩的病因是患者存在着中毒。

中毒因素包括药物中毒或者重金属中毒，患者一定要积极查找有没有接触这些毒物。

另外，如果患者存在严重的高血压，糖尿病或者高脂血症，也有可能引起海马体萎缩，此时，控制方法就是积极的防控上述危险因素。

另外，如果患者存在阿尔茨海默病，此时，控制海马体萎缩的方法就是服用多奈哌齐或者美金刚等，但是即使服用药物也是非常难控制的。