最常见的是由于各种原因导致孩子的肠胃功能受损，孩子正常的肠道蠕动节律被破坏，不能把吃进去的食物正常的消化吸收排泄。

可以是跟感染相关，包括各种细菌感染，病毒感染，支原体感染，衣原体感染，原虫感染，真菌感染等，也有的孩子是跟过敏相关。当各种过敏源的刺激，可以诱导孩子胃肠道的过敏，出现过敏性结肠炎。可以是对周围的环境过敏，包括粉尘、尘螨、花草、宠物，也可以是对接触的床单、被褥等。而有的孩子，则是对饮食过敏，包括异体蛋白饮食、膨化剂、添加剂的食物。